Grand-croix de la Légion d’honneur française, 2001
Docteur Honoris Causa de l’Université Jean Moulin de Lyon III, 2004
Docteur Honoris Causa en développement ressources humaines, de l’Université Ramkhamhoeng de Bangkok, 2005
Diplôme d’honneur et de mérite de la Conférence des institutions d’enseignement et de recherche économique et de gestion en Afrique (CIERA), 2005
Commandeur de l’Ordre international des Palmes académiques du Conseil africain et malgache pour l’enseignement supérieur (CAMES), le 29 avril 2005, puis Grand-croix en 2012 (488)
Docteur Honoris Causa de l’Institut International de l’Ingénierie de l’Eau et de l’Environnement 2iE, 2009
Médaille de la gloire de la Fondation pour la démocratie en Afrique pour les efforts accomplis par le Burkina Faso sous sa direction dans le domaine de la sécurité alimentaire, la bonne gouvernance et son leadership dans la sous-région en sa qualité de facilitateur dans la résolution des conflits, 2010 (489)
Grand-croix de l’Ordre National du Mérite de Guinée, en reconnaissance, notamment, de sa contribution personnelle déterminante dans la transition engagée en Guinée, 2010
Grand-croix de l’Ordre National du Mérite de la République du Mali, 2013
Lauréat du Prix de la Fondation Crans Montana pour ses actions en faveur de la paix, de la démocratie et du développement dans son pays et en Afrique (491)